La Gastroenterología Pediátrica se ocupa de las enfermedades del esófago, estómago, intestino, páncreas, vías biliares e hígado. 

Ejemplos de estas enfermedades son el dolor de barriga, el reflujo, la gastritis por Helicobacter pylori, la enfermedad celiaca, el aumento de transaminasas, la intolerancia a la lactosa, la malabsorción de fructosa, las alergias a alimentos, el síndrome del intestino corto, la enfermedad de Crohn y la colitis ulcerosa, el estreñimiento, la enfermedad de Hirschsprung, las hepatitis, las piedras en la vesícula biliar, la pancreatitis, etc. 

Determinantes son la anamnesis, el crecimiento en la curva de percentiles, a menudo un protocolo de la alimentación y una toma de sangre. Sin embargo en una parte de los pacientes son necesarias otras exploraciones complementarias (pH-metría, tests de lactosa y fructosa, ecografía, test del sudor, gastroscopias y coloscopias, biopsia de recto, resonancia magnética, etc.)

Dado lo complicado de estos casos, la cantidad de aparatos que habría que tener en la consulta y el sistema de retribución existente en Alemania, hemos decidido no ofrecer la gastroenterología más que a los pacientes propios de la consulta en forma reducida.